Лично для меня такой вопрос не стоит, там где это возможно, я предпочитаю использовать FreeBSD.

Однако, если речь идет о корпоративном сервере, то тут к выбору операционной системы отличной от Windows нужно подходить аккуратнее. Самое важное при выборе OC – это поддержка производителей серверного “железа”, поддержка  производителей корпоративного ПО и возможность, при необходимости, получить поддержку от производителя ОС.

Самая разумная альтернатива Windows на корпоративном сервере – это » читать дальше